Istnieje kilka metod czyszczenia systemów wentylacyjnych. Aby określić metodę czyszczenia i potrzebę dezynfekcji, najpierw przeprowadza się kontrolę systemu. Główne elementy systemu wentylacyjnego są przed czyszczeniem sprawdzane przez specjalistów, którzy wizualnie określają grubość osadów i obecność w nich tłuszczu i innych zanieczyszczeń.